- Área de Ciencias de la Salud
- Área de Ciencias Básicas
- Área de Ciencias Económicas y de la Gestión
- Área de Humanidades, Ciencias Jurídicas y Sociales
- Área de Ingeniería
A partir del semestre 2021-II se aprobó el pase de los Estudios Generales a las facultades, mediante Resolución Rectoral N° 010634-2021-R/UNMSM.